Diversity in germination response among Bacillus licheniformis strains
Master thesis
Permanent lenke
http://hdl.handle.net/11250/186404Utgivelsesdato
2012-09-12Metadata
Vis full innførselSamlinger
- Master's theses (KBM) [944]
Sammendrag
Flere studier har blitt utført for å beskrive germineringsegenskaper i forskjellige Bacillus
licheniformis-stammer. Stammene har påviste forskjeller i operonet som koder for
germineringsreseptoren GerA, som er forbundet med L-alanin-indusert germinering.
For å studere funksjonen til GerA-reseptoren ble en disrupsjons-mutant, der deler
av gerAA i gerA-operonet er fjernet, konstruert fra en av stammene som er inkludert i
undersøkelsene, MW3. MW3 ligner typestammen, men to type I restriksjonsmodifikasjons-
systemer er fjernet. Disrupsjonsmutanten ble benyttet til å konstruere to
komplementeringsmutanter transformert med gerA fra MW3 og en annen stamme (NVH-
1032). Ytterligere tre stammer (NVH-B357, NVH-800 og NVH-1112) ble inkludert
senere, og tre nye komplementeringsmutanter med gerA fra disse stammene ble
konstruert.
For å kartlegge uttrykk av gerA i komplementeringsmutanten sammenlignet med
villtypen ble en real-time PCR-analyse gjennomført for gerAA, sigG og rpoB. Analysen
ga relativ ekspresjon av gerA og sigG, som kontrollerer ekspresjon av reseptoren
sammenlignet med et «house-keeping»-gen, rpoB, som uttrykkes relativt stabilt. Til å
begynne med skal MW3 og dens komplementeringsmutant analyseres, og på bakgrunn av
disse resultatene vil eventuelt flere stammer inkluderes i analysen.
Germineringsanalysene viste klare forskjeller mellom de forskjellige stammene,
som muligens kunne relateres til forskjeller i gerA-sekvensene. Disrupsjonsmutanten
germinerte i liten eller ingen grad. En analyse med kalsium og dipikolinsyre som
germinant ble utviklet for å omgå reseptormediert germinering. Foreløpige resultater viser
uensartet germinering for de forskjellige stammene. Analyseresultatene viser at
disrupsjonsmutanten kan germinere med disse germinantene til tross for at GerA mangler.
På dette tidspunktet presenteres kun ett resultat fra real-time-PCR-analysen. Dette
viser uttrykk av gerA gjennom sporulering av MW3. Det ser ut som tendensen er at gerAuttrykkes
omtrent ti ganger høyere i komplementeringsmutanten sammenlignet med
villtypen. Videre analyser er nødvendige før det er mulig å konkludere med noe.
Beskrivelse
Studier av germineringsegenskaper i Bacillus licheniformis-sporer