Utvikling av en MultiLocus Variable Number Tandem Repeat Analyse (MLVA) for den fiskepatogene bakterien Moritalla viscosa

Abstract

Den Gram-negative bakterien Moritella viscosa forårsaker sykdommen «vintersår» i oppdrettsanlegg med laks og regnbuørret i Nord-Atlanteren når vanntemperaturen er lav. Vintersår er en økonomisk viktig sykdom i den norske oppdrettsnæringen, og er også et viktig dyrevelferdsproblem, da fisk som har sykdommen kan leve lenge med kroniske sår. Det finnes kommersielle vaksiner mot sykdommen, men det forekommer stadig utbrudd blant vaksinert laks og regnbueørret i Norge. I denne studien ble det utviklet en Multilocus Variable Number Tandem Repeat Analysis (MLVA) for bakterien M. viscosa, og genet gyrB ble sekvensert og analysert i flere stammer av bakterien. Resultatene fra sekvenseringsanalysen viste en tydelig oppdeling av isolater i to grupper: «typiske M. viscosa», nesten utelukkende isolert fra laks, og «atypiske» M. viscosa, isolert fra flere forskjellige fiskearter. I MLVA grupperte de typiske isolatene sammen i en egen klade som korrelerte sterkt med gyrB-resultatene. De atypiske isolatene grupperte seg ikke sammen, men i tre klonale grupper. To av disse var assosiert med virulens og vertsspesifisitet; den ene gruppen bestod av relativt nye lakseisolater, og den andre av isolater utelukkende fra regnbueørret. Disse funnene kan være av betydning for utviklingen av fiskevaksiner mot vintersår. MLVA-metoden viste også at det ofte var flere enn en stamme av M. viscosa som ble isolert fra det samme utbruddet av vintersår, noe som er relevant epidemiologisk informasjon ved identifisering av stammer som forårsaker utbrudd. Metoden viste høy oppløsning ved typing av M. viscosa, men denne ble betraktelig lavere når kun lakseisolater ble analysert. Det bør foretas videre studier for å evaluere metoden for epidemiologisk bruk. Metoden er relativt rask å utføre, sammenliknet med andre genetiske analyser av M. viscosa, og burde være mulig å uføre i andre laboratorier med liknende utstyr.