Vis enkel innførsel

dc.contributor.advisorRudi, Knut
dc.contributor.advisorAvershina, Ekaterina
dc.contributor.authorSlangsvold, Silje
dc.date.accessioned2016-08-10T12:26:32Z
dc.date.available2016-08-10T12:26:32Z
dc.date.issued2016-08-10
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11250/2398671
dc.description.abstractDen vaginale mikrobiota er en viktig del av kroppens forsvar mot patogene mikroorganismer. De dominerende bakteriene i den vaginale mikrobiota produserer melkesyre, som skaper et surt miljø, som er med på å hindre vekst av patogene mikroorganismer. Det er hovedsakelig arter av Lactobacillus som produserer denne melkesyren. Probiotika er et uttrykk som refererer til ikkepatogene bakteriell- eller gjær mikrobiota som skal være gunstig for verten ved å alterere mikrobiota ved kolonisering. Det er svært vanlig å bruke melkesyreproduserende bakterier i probiotika. Probiotika har gunstig effekt på fordøyelsessystemet i forbindelse med ubalanse forårsaket av en antibiotikakur. Probiotikas effekt på den vaginale mikrobiota hos gravide kvinner var hovedmålet med denne oppgaven. I tillegg var målet å undersøke om den vaginale mikrobiota endret seg gjennom svangerskapet. Det siste delmålet innebar å undersøke om tilstedeværelsen av blod i prøvene endret den vaginale mikrobiota. 379 prøver fra uke 36 i svangerskapet eller ved fødselen utgjorde prøvematerialet i denne oppgaven. Metodene som ble brukt i forbindelse med denne oppgaven involverte genomisk DNA ekstraksjon, kvalitativ- og kvantitativ polymerase chain reaction (PCR), Illumina 16S index PCR, samt 16S rRNA metagenom sekvensering. To operasjonelle taksonomiske enheter (OTU) var signifikante med hensyn til probiotika. OTU’ene ble identifisert til å være en ukjent udyrkbar bakterie og en bakterie som tilhørte familien Bifidobacteriaceae. Det ble observert en signifikant økning av proteobakterier, og en nedgang av clostridium bakterier. OTU’ene som forekom i flest sekvenser var Lactobacillus iners, en art fra Bifidobacteriaceae familien, en art fra Coriobacteriaceae familien, en art fra Megasphaera slekten, en art fra Enterobacteriaceae familien, en art fra Bifidobacterium slekten og fire andre arter som tilhørte slekten Lactobacillus. Lactobacillus iners og potensielt de fire artene som tilhørte Lactobacillus slekten, samsvarer med tidligere observasjoner når det kommer til dominant vaginal mikrobiota. De fem andre OTU’ene skiller seg derimot ut. Megasphaera har blitt funnet å dominere den vaginale mikrobiota hos friske kvinner før, men den økte tilstedeværelsen av de fire siste OTU’ene har vist seg vanskelig å forklare. Probiotika hadde ikke endret den vaginale mikrobiota gjennom svangerskapet. Den vaginale mikrobiota hadde endret seg i løpet av svangerskapet, uavhengig av probiota. Det ble det ikke funnet noen forskjell mellom prøvene med blod og uten blod. Den vaginale mikrobiota ble funnet til å være mer stabil innad individene over tid enn mellom individene.nb_NO
dc.description.abstractThe vaginal microbiota is an important part of the human body’s defense from pathogenic microorganisms. The dominating bacteria in the vaginal microbiota produce lactic acid which help create an acidic environment which prevents the growth of pathogenic microorganisms. There are mainly Lactobacillus ssp. that produce this lactic acid. Probiotics is a term that refers to nonepathogenic bacterial- or yeast microbiota that are supposed to be beneficial for the host by changing the microbiota by colonization. It is very common to use lactic acid- producing bacteria in probiotics. Probiotics have a beneficial effect in conjunction with unbalance in the gut microbiota caused by antibiotics. Probiotics effect on the vaginal microbiota of pregnant women was the main question in this thesis. In addition, it was the aim to investigate if the vaginal microbiota changed during the pregnancy. Finally, it was the aim to investigate whether the presence of blood in the samples changed the vaginal microbiota. The sample material in this thesis consisted of 379 samples from week 36 in the pregnancy or at birth. The methods used in this study involved genomic DNA extraction, qualitative and quantitative PCR, Illumina 16S index PCR and 16S rRNA metagenome sequencing. Two operational taxonomic units (OTU) were significant with regards to probiotics. The OTUs were identified as an unknown unculturable bacteria and a bacteria belonging to the family Bifidobacteriaceae. It was observed a significant increase in proteobacteria, and a decrease in clostridium bacteria. The OTUs that occurred in the most sequences were Lactobacillus iners, a species from the Bifidobacteriaceae family, a species from the Coriobacteriaceae family, a species from the Megasphaera genus, a species from the Enterobacteriaceae family, a species from the Bifidobacterium genus and four other species that belonged to the genus Lactobacillus. Lactobacillus iners and potentially the four species belonging to the genus Lactobacillus, are consistent with previous observations of dominant vaginal microbiota. The five other OTUs stands out from these observations. Megasphaera has been found to dominate the vaginal microbiota in healthy women before, but the increased presence of the four last OTUs has proved difficult to explain. Probiotics did not change the vaginal microbiota during the pregnancy. The vaginal microbiota had changed during the pregnancy, regardless of probiotics. It was not observed any difference between the samples with blood and the samples without blood. The vaginal microbiota was found to be more stable within individuals over time than between individuals.nb_NO
dc.language.isonobnb_NO
dc.publisherNorwegian University of Life Sciences, Ås
dc.subjectProbiotikanb_NO
dc.subjectMikrobiotanb_NO
dc.subjectVaginal mikrobiotanb_NO
dc.subjectGraviditetnb_NO
dc.titleVaginal mikrobiota hos mødre fra en probiotika studienb_NO
dc.typeMaster thesisnb_NO
dc.subject.nsiVDP::Mathematics and natural science: 400::Basic biosciences: 470::General microbiology: 472nb_NO
dc.source.pagenumber65nb_NO
dc.description.localcodeM-MBnb_NO


Tilhørende fil(er)

Thumbnail

Denne innførselen finnes i følgende samling(er)

Vis enkel innførsel