Morsmelk som mulig kilde til overføring av bakterier med integroner til spedbarn.

Abstract

Morsmelk er den viktigste næring for spedbarn i de første månedene av livet. Tidligere var morsmelk ansett som steril, men mye forskning viste at den inneholder bakterier. Siden morsmelk er den førte næring barn for, spiller den en viktig rolle i utvikling av tarmflora hos spedbarn. Riktig utvikling av tarmfloraen er avgjørende for barnas helse. På grunn av den viktige rolle, som tarmfloraen har på spedbarns helse var mye forskning utført innefor dette området. Forskningene på avføring til spedbarn viste at bakteriene i tarmfloraen hos barn inneholder integroner. Integroner er genetiske elementer, som bærer antibiotikaresistente gener. I denne studien ble det undersøkt om morsmelken kan være en kilde til integroner i bakteriene hos barn. Det ble i tillegg undersøkt taksonomisk sammensetning av bakteriene i morsmelkprøver ved hjelp av 16S rRNA genet. Deteksjon av integroner i morsmelkprøver var utført ved hjelp av integrase genet (int 1) og HMR analysen. Resultatene for deteksjonen viste ingen prøver positive for int 1 genet. Primere som var bruk i analysen var rettet mot integroner av gram-negative bakterier. Resultatene av taksonomisk analysen viste at prøvene var dominert med gram-positive bakterier, derfor var prøvene med stor innehold av gram-positive bakterier selektert, og analysert med gram-positive primere. Ved hjelp av Sanger sekvensering og BLAST søk ble det funnet to prøver positive for int 1genet. Disse resultatene tyder på at morsmelken er sannsynlig ikke en kilde til integroner i avføring hos spedbarn. Taksonomisk analyse av morsmelkprøvene viste at de mest dominerende familier i både 10/90 dager prøvene og placebo/probiotisk Biola prøvene er Staphylococcaceae, Streptococcaceae. Innhold av Moraxellaceae familien varierer mellom prøvene isolert etter 10/90 dager og placebo/probiotisk Biola prøvene. 16S rRNA sekvensering hadde mange sekvenser med dårlig kvalitet. På grunn av dette burde sekvenseringen gjentas.

Breast milk is the most important food for infants during the first months of life. Previously breastmilk has been considered sterile, but much research showed that it contains bacteria. Since breast milk is the first food that children are getting, it plays an important role in development of intestinal flora in infants. Proper development of the intestinal flora is essential for children's health. Because of the important role that gut flora have on infant health, much research was done within this area. Researches on stools samples of infants showed that bacteria in the gut flora of children contain integrons. Integrons are genetic elements that contain antibiotic resistance genes. In this study, we investigated whether human milk can be a source of integrons in bacteria in children. It was also examined taxonomic composition of the bacteria in milk samples using the 16S rRNA gene. Detection of integrons in breas milk samples was performed using the integrase gene (int 1) and HMR analysis. The results for detection showed no samples posit ive for int 1 gene. The primers used in the analysis were targeting integrons of gram-negative bacteria. The results of taxonomic analysis showed that the samples were dominated by gram-positive bacteria, therefore the samples with high content of gram-positive bacteria were selected and analyzed using gram-positive primers. Using Sanger sequencing and BLAST search two samples were found to be positive for int 1genet. These results suggest that breast milk is likely not a source of integrons in stools samples of infants. Taxonomic analysis of breast milk samples showed that the most dominant families in both 10/90 days samples and placebo / probiotic Biola samples are Staphylococcaceae, Streptococcaceae. A content of Moraxellaceae family varies between samples isolated after 10/90 days and placebo / probiotic Biola samples. 16S rRNA sequencing had many sequences with poor quality. Because of that the sequencing should be repeated.