Vis enkel innførsel

dc.contributor.authorRamse, Merete
dc.date.accessioned2014-08-01T11:01:02Z
dc.date.available2014-08-01T11:01:02Z
dc.date.copyright2014
dc.date.issued2014-08-01
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11250/216545
dc.description.abstractI straffesaker benyttes blant annet biologiske spor, som epitelceller, hår, blod etc., til å identifisere eventuelle mistenkte, vitner og fornærmede. I dagens rutine ved Avdeling for biologiske spor (RESP), Folkehelseinstituttet (FHI), sikres mulig cellemateriale fra ulike gjenstander (f.eks. et klesplagg, en skrutrekker etc.) i hovedsak ved vattpinneavstryk eller ved direkte utklipp fra materialet. En alternativ sporsikringsmetode er å bruke en kommersiell mini-tape som er produsert med sporsikring som formål. Hensikten med dette prosjektet var å sammenlikne dagens vattpinnemetode mot sporsikring med mini-tape ved sikring av epitelceller fra ulike tekstiloverflater. På bakgrunn av resultatene, brukervennlighet og pris skulle det vurderes om sporsikring med mini-tape er en bedre egnet sporsikringsmetode enn vattpinne ved sikring av epitelceller fra tekstiler, og om denne metoden dermed bør implementeres i rutinen ved sporavdelingen. I første del av prosjektet ble to ulike mini-taper testet; Scenesafe FASTTM og WA Products «1 tape kit», som begge er laget spesielt med tanke på sikring av biologiske spor. Tapetypene ble benyttet på tre ulike tekstiloverflater og DNAet ble ekstrahert med to ulike ekstraksjonsmetoder, hhv. 5 % Chelex-løsning (Chelex 100 Resin) og QIAamp (Qiagen). Mini-tapen og ekstraksjonsmetoden som ut fra en samlet vurdering var best egnet for sporsikring ble benyttet videre i prosjektet. Det ble benyttet standard statistiske metoder, inkludert variansanalyse, og de fleste beregningene ble utført i statistikkprogrammet ”R” og overbygningen ”R Commander”. Ved sammenlikning av de to tapetypene viste typeresultatene for Scenesafe FASTTM og WA Products «1 tape kit» ingen signifikante forskjeller, og prisen på de to tapetypene var tilnærmet lik. Scenesafe FASTTM fremsto imidlertid som mer brukervennlig, både ved sporsikring og ekstraksjon, da den var mindre klebrig enn WA Products «1 tape kit». Ved sammenlikning av ekstraksjonsmetodene ga Chelex-ekstraksjon signifikant bedre typeresultater enn ekstraksjon med QIAamp. I tillegg var Chelex-ekstraksjon både en billigere og raskere metode å anvende i rutinen. På bakgrunn av disse resultatene ble det bestemt å benytte mini-tapen Scenesafe FASTTM og ekstrahering av DNA med Chelex videre i prosjektet. I andre del av prosjektet ble sporsikring av epitelceller fra ulike tekstiloverflater med mini-tape (Scenesafe FASTTM) ekstrahert med Chelex sammenliknet mot dagens rutinemetode ved Avdeling for biologiske spor som er vattpinne (Tubed Sterile DryswabTM Wood Shaft, MWE) ekstrahert med Chelex. Begge sporsikringsmetodene ble benyttet for å sikre epitelceller fra tre ulike tekstiloverflater. Sporsikring med mini-tape ga signifikant høyere DNA-kvantiteringsverdier enn sporsikring med vattpinne. Ved å vurdere typeresultatene ut fra styrke i form av allellhøyde, ga prøvene sikret med mini-tape signifikant sterkere typeresultater enn prøvene sikret med vattpinne. På grunnlag av dette er det rimelig å konkludere at sporsikring på tekstiler med mini-tape vil gi bedre typeresultater enn sporsikring med vattpinne, også i rutinen ved sporavdelingen i reelle saker. Ved den praktiske sporsikringen var mini-tapen enkel å bruke, og foretrukket fremfor vattpinnen. Imidlertid ble tapen noe statisk da den skulle overføres til prøverøret. På bakgrunn av resultatene fra dette forsøket, samt vurderingene rundt brukervennlighet og pris har sporsikring med mini-tape (Scenesafe FASTTM) og påfølgende DNA-ekstraksjon med Chelex i hovedsak erstattet vattpinneavstryk ved sikring av epitelceller fra tekstiler ved Avdeling for biologiske spor. In criminal cases biological material, such as epithelial cells, hair, blood etc., are often used to identify suspects, victims and witnesses. The Department of Forensic Biology, Norwegian Institute of Public Health, mainly uses cottonswab or directly cutting as a sampling method to collect possible cellular material from different objects (for example clothing, screwdriver etc.). An alternative method is to use a commercial minitape produced with the purpose of recovering biological material from surfaces in criminal cases. The purpose of this project was to compare the current cottonswab method with the tape-lifting method for recovering of epithelial cells from different textile surfaces. Based on the outcome of the tests, the ease of use and costs of the different methods it was evaluated whether tape-lifting is a better method compared to swabbing when recovering epithelial cells from textiles. Further, it was evaluated if tape-lifting should be implemented in the routine at the department. In the first part of the project two different minitapes were tested; Scenesafe FASTTM and WA Products «1 tape kit». Both tapes are made with the purpose of recovering biological material in casework. The minitapes were tested on three different types of fabrics, and the DNA was extracted with two different methods; 5 % Chelex solution (Chelex 100 Resin) and QIAamp (Qiagen). The minitape and the method of extraction that, based on an overall assessment, were best suited to recover these epithelial cells were used further in the project. Standard statistical methods, including Analysis of variance, were used and most analyses were performed using “R”. When the different minitapes were compared, the results were not showing any significant differences between Scenesafe FASTTM and WA Products «1 tape kit», and the price of the two tapes was approximately equal. However, Scenesafe FASTTM appeared more user friendly as it was less sticky than WA Products «1 tape kit». When the two different extraction methods were compared, the extraction with Chelex gave significant better results than extraction with QIAamp. Also, the Chelex extraction is a quicker method as well as less expensive to use in the routine. Based on these results it was decided to use Scenesafe FASTTM with Chelex extraction further in the project. In the second part of the project the minitape (Scenesafe FASTTM) followed by DNA extraction with Chelex were compared to the current method at the department, which was cottonswab (Tubed Sterile DryswabTM Wood Shaft, MWE) also extracted with Chelex, to recover epithelial cells from different types of fabrics. Both methods were used to recover epithelial cells from similar areas on a t-shirt, cap, and wristband used by ten volunteers. The results of the tests demonstrate significantly higher DNA concentrations from the samples collected with minitape compared to the samples collected with cottonswab. By assessing the DNA profiles by strength in terms of allele height, the samples collected with minitape gave stronger profiles than the samples collected with cottonswab. Based on this it is reasonable to assume that recovering of epithelial cells from textiles will provide more and better DNA profiles when collected with minitape than cottonswab, also in the routine work at the department (i.e. real casework). On the practical aspects, minitape was easy to use, and preferred to swabbing, as a sampling method. However, it did appear to be slightly static when transferring the tape fragments to the DNA tubes. Based on the results from this experiment, as well as opinions about usability and price, the minitape (Scenesafe FASTTM) with subsequent Chelex extraction has mainly replaced the cottonswabs in the routine work at the Department of Forensic Biology when collecting epithelial cells from textiles.nb_NO
dc.language.isonobnb_NO
dc.publisherNorwegian University of Life Sciences, Ås
dc.subjectVDP::Teknologi: 500::Bioteknologi: 590nb_NO
dc.titleUttesting av ny sporsikringsmetode for epitelceller fra tekstilernb_NO
dc.title.alternativeExamination of a new method to recover epithelial cells from textile surfacesnb_NO
dc.typeMaster thesisnb_NO
dc.source.pagenumber75nb_NO
dc.description.localcodeM-BIOTEKnb_NO


Tilhørende fil(er)

Thumbnail

Denne innførselen finnes i følgende samling(er)

Vis enkel innførsel