Syndrombasert overvåking i beredskap mot utbrudd : en analyse av signaler om utbrudd av mage-tarminfeksjon i Sykdomspulsen
Master thesis
View/ Open
Date
2018Metadata
Show full item recordCollections
- Master’s theses (LandSam) [1236]
Abstract
Bakgrunn: Syndrombasert overvåking kan bidra til raskere avdekking av sykdomsutbrudd. Siden 2016 har det syndrombaserte overvåkingssystemet Sykdomspulsen, blitt brukt til overvåking av konsultasjoner for mage-tarminfeksjoner i Norge. Effekten av syndrombasert overvåking og Sykdomspulsens evne til å avdekke utbrudd av mage-tarminfeksjon, er hittil ikke evaluert. I studien sammenliknet jeg data om utbrudd av mage-tarminfeksjon fra Sykdomspulsen, helseregisteret MSIS og utbruddsvarslingssystemet Vesuv. Formålet var å undersøke om MSIS og VESUV er gode sammenlikningsgrunnlag for en fremtidig evaluering av Sykdomspulsen.
Materiale og metode: Studien er basert på data fra Sykdomspulsen om alle konsultasjoner i allmennlegetjenesten for symptomdiagnosegruppen mage-tarminfeksjoner, for årene 2007-17. Videre benyttes anonymiserte data fra MSIS for et utvalg meldingspliktige diagnoser for mage-tarminfeksjon, aggregert på uke- og kommunenivå. Tilslutt ble data fra alle utbrudd som er varslet Vesuv, med hovedsymptomer oppkast og/eller diare i studieperioden inkludert. Utbruddssignaler i MSIS ble konstruert ved hjelp av en tilpasset algoritme basert på Poisson-modell. Utbruddssignaler i Sykdomspulsen, MSIS og Vesuv ble deretter sammenliknet og analysert. Avslutningsvis ble korrelasjon mellom Sykdomspulsen-data og MSIS-data undersøkt.
Resultater: Det ble funnet et betydelig høyere antall utbruddssignaler i Sykdomspulsen, enn i MSIS og Vesuv. Beregninger for Sykdomspulsen, basert på MSIS og Vesuv som referansedata, tilkjennega lave verdier for sensitivitet (> 15 %) og positiv prediktiv verdi (> 4 %). Det ble ikke funnet signifikant korrelasjon mellom Sykdomspulsen-data og MSIS-data.
Konklusjon: Funnene i studien gir ikke indikasjoner på at MSIS- og Vesuv-data er egnede sammenlikningsgrunnlag for en evaluering av Sykdomspulsen. Store mørketall og manglende "gullstandard" for overvåking av mage-tarminfeksjoner, gjør det utfordrende å finne egnet datagrunnlag, for sammenlikning og evaluering av Sykdomspulsen. Fremtidige studier bør utforske eksisterende og nye systemer for syndrombasert utbruddsovervåking av mage-tarminfeksjon, og identifisere beste praksiser for evaluering av slike systemer. Introduction: Syndromic surveillance offers the potential to rapidly detect disease outbreaks. Since 2016, the syndromic surveillance system Sykdomspulsen has been used to monitor consultations regarding gastroenteritis in general practitioner (GP) services in Norway. The effect of syndromic surveillance and Sykdomspulsen's ability to detect outbreaks of gastroenteritis are yet to be evaluated. In this study, I examined the usefulness of comparing outbreak signals of gastroenteritis in Sykdomspulsen, the health registers MSIS and the outbreak rapid alert system Vesuv, for a future evaluation of Sykdomspulsen.
Methods: The study is based on data from Sykdomspulsen, on all consultations in GP services regarding symptoms included in the gastroenteritis symptom syndromic group, from year 2007-17. Anonymous data from MSIS for a selection of notifiable gastrointestinal infection diagnoses was also included, aggregated at weekly and municipal level. Finally, data was added, from all outbreaks notified in Vesuv, where main symptoms were vomiting and / or diarrhoea during the study period. Outbreak signals in MSIS were created, by using a simple algorithm based on the Poisson model. Outbreak signals in Sykdomspulsen, MSIS and Vesuv, were compared and analysed. Finally, correlations between Sykdomspulsen-data and MSIS-data was examined.
Results: A substantially higher number of outbreaks signals were found in Sykdomspulsen, compared to MSIS and Vesuv. Calculations for Sykdomspulsen, based on MSIS and Vesuv as reference data, indicated low values for sensitivity (>15%) and positive predictive value (>4%). Significant correlation between Sykdomspulsen-data and MSIS-data was not found.
Conclusions: The findings gives no indications for MSIS and Vesuv-data being a suitable base for comparisons in an evaluation of Sykdomspulsen. Large unrecorded numbers of cases and outbreaks, and lack of "gold standard" for monitoring gastrointestinal infections, makes it challenging to find suitable data bases, for comparison and evaluation of Sykdomspulsen. Future studies should explore existing and new systems for syndromic outbreak surveillance of gastrointestinal infections, and identify best practices for the evaluation of such systems.