Reconstruction and modelling of amino acid synthesis in Salmo salar

Abstract

This thesis documents the process behind the reconstruction of the Salmo Salar Amino Acid Synthesis model (SalSAA). The model is a mathematical description of amino acid biosynthesis and protein polymerisation in Atlantic salmon. Flux balance analysis was performed to study the effect of the amino acid composition of fish meal versus soyben meal on protein polymerisation. As indicated by earlier reseach, fish meal has a composition of amino acids promoting higher growth rate for protein than soybean meal. The model also correctly predicts the most beneficial amino acid additions to soybean meal to promote growth.

Dette dokumentet dokumenterer prosessen bak rekonstruksjonen av den støkiometriske modellen for aminosyresyntese og proteinpolymerisering i atlanterhavslaks (SalSAA). Modellen er en matematisk beskrivelse av aminosyresyntese og proteinpolymerisering i Atlanterhavslaks. Det ble gjort simuleringer for ̊a studere effekten av protein fra fiskemel og soyamel p ̊a proteinsyntese. Tidligere forskning tilsier at fiskemel har en komposisjon av aminosyrer som fremmer vekst bedre enn soyamel, hvilket ble bekreftet av modellen. Simuleringene foruts ̊a ogs ̊a korrekt hvilke aminosyretilsetninger som forbedrer vekst p ̊a soyamel best.