Screening etter antibiotikaresistente bakterier i jordprøver og identifisering av mecC MRSA

Abstract

Bakterier som blir resistente mot ulike typer antibiotika er et økende problem over hele verden. Dette er noe som ikke bare påvirker det medisinske fagfeltet direkte, men også mennesker og dyr generelt og matproduksjon. Denne oppgaven gikk ut på å lete etter antibiotikaresistente bakterier innen tre av de vanligste gruppene av resistente bakterier i prøver tatt fra naturlig miljø. Dette var MRSA, ESBL og CRE. Deretter ble prøvene dyrket opp og gikk gjennom ulike molekylærbiologiske undersøkelser. Deriblant PCR, første- og tredjegenerasjonssekvensering. Resultatet var at det ble funnet antibiotikaresistente bakterier i de aller fleste av prøvene. Blant disse var kanskje det første funnet av mecC MRSA i jordsmonn i Norge.

Bacterias developing resistance towards various groups of antibiotics is a global problem. Not only does it affect the medical field, but also human life and animals in general, as well as food production. The aim of this thesis was to search for antibiotic resistant bacteria within three of the most common groups of resistance. Those were MRSA, ESBL and CRE. The samples were cultured in growth media and went through first and third generation sequenc-ing. The results were that antibiotic resistant bacteria were found in most of the samples. Among there was the discovery of what probably is the first detected occurrence of mecC MRSA in soil in Norway.